Переходим в Касса и кликаем Новая транзакция (в левом верхнем углу экрана):

В открывшемся окне Новая транзакция кликаем:
1. Внесение
2. По полю Клиент (погашение задолженности)

В открывшемся окне Клиенты выбираем клиента, долг которого нужно погасить

Вводим нужную сумму денежных средств и кликаем Сохранить
